Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tnfsf18Q7TS55 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tnfsf18Q7TS55 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tnfsf18Q7TS55 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tnfsf18Q7TS55 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Tnfsf18Q7TS55 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tnfsf18Q7TS55 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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