Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms