Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TwistnbQ78WZ7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TwistnbQ78WZ7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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