Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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