Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms