Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Tmeff1Q6PFE7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms