Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim37Q6PCX9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim37Q6PCX9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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