Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms