Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CltbQ6IRU5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms