Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt87Q6IMF0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms