Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Atg9bQ6EBV9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atg9bQ6EBV9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms