Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rftn1Q6A0D4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rftn1Q6A0D4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms