Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Zfp248Q640N4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Zfp248Q640N4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms