Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cd53Q61451 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cd53Q61451 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cd53Q61451 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cd53Q61451 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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