Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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PcolceQ61398 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PcolceQ61398 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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