Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atf3Q60765 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms