Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mkrn3Q60764 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mkrn3Q60764 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms