Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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PtprnQ60673 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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PtprnQ60673 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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PtprnQ60673 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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PtprnQ60673 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PtprnQ60673 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PtprnQ60673 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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PtprnQ60673 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms