Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim58Q5NCC9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms