Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Xirp2Q4U4S6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms