Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM5

Miga1, Mitoguardin 1, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Miga1Q4QQM5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Miga1Q4QQM5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Miga1Q4QQM5 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Miga1Q4QQM5 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms