Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms