Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ckap2Q3V1H1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms