Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Q3V0E1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Q3V0E1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms