Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Txk-206ENSMUST00000198464 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ppcdc-201ENSMUST00000085709 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms