Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc114Q3UX62 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc114Q3UX62 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms