Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nlrc4Q3UP24 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrc4Q3UP24 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms