Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctsll3Q3ULP7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms