Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BtrcQ3ULA2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BtrcQ3ULA2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
BtrcQ3ULA2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
BtrcQ3ULA2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms