Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp19Q3UJD6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp19Q3UJD6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Usp19Q3UJD6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Usp19Q3UJD6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Usp19Q3UJD6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp19Q3UJD6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms