Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc34Q3UI66 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc34Q3UI66 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms