Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Nkx6-3Q3UHX8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nkx6-3Q3UHX8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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