Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snx27Q3UHD6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms