Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nom1Q3UFM5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nom1Q3UFM5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms