Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4S0

Pank2, Pantothenate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank2Q3U4S0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pank2Q3U4S0 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pank2Q3U4S0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms