Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ssbp4Q3U4B1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ssbp4Q3U4B1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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