Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms