Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rasip1Q3U0S6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rasip1Q3U0S6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms