Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trappc9Q3U0M1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trappc9Q3U0M1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms