Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hace1Q3U0D9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hace1Q3U0D9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms