Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc10Q3TLI0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc10Q3TLI0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms