Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2afvQ3THW5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms