Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam107bQ3TGF2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms