Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Col24a1Q30D77 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Col24a1Q30D77 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Col24a1Q30D77 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms