Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrriq1Q0P5X1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms