Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Ttc21bQ0HA38 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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Ttc21bQ0HA38 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ttc21bQ0HA38 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ttc21bQ0HA38 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Ttc21bQ0HA38 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ttc21bQ0HA38 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ttc21bQ0HA38 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ttc21bQ0HA38 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms