Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Aplp2Q06335 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Aplp2Q06335 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms