Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox12Q04890 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms