Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sox8Q04886 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sox8Q04886 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sox8Q04886 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms