Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smpd1Q04519 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smpd1Q04519 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms